Вопросы, решение которых входит в компетенцию территориального отдела: осуществление федерального государственного надзора и контроля за исполнением обязательных требований законодательства РФ в области обеспечения санитарно-эпидемиологического рынка; предотвращение вредного воздействия на человека факторов среды обитания; профилактика инфекционных и массовых инфекционных заболеваний (отравлений) населения.